故事的舞台设定在公历2034年,也就是动画版GIG“难民事件”结束的两年后。增员20人的新重组的公安九课又再临危受命,调查以梵文刺青为标志的恐怖分子的连续自杀事件以及机场人质劫持事件。从疑犯口中得知,潜藏于事件背后的幕后黑手,是一个被称为“傀儡回”的超高级黑客。巴特在一次暗中调查时,与久违两年的少佐草薙素子不期而遇,然而重逢十分短暂,素子神秘的行动,以及那句“不要接近Solid State Society”的忠告,就连巴特也误认为素子就是“傀儡回”。 因两年前素子的失踪而被任命为队长的陀古萨,正在为神秘自