东京大地震十年后,人们逐渐淡忘这场大灾难所带来的恐怖回忆,当时亲身经历了这场灾难的男主角「五十岚丸太」,却因当时的意外而丧失了记忆。现今的丸太与其他同学过着普通而平凡无奇的每一日,但这一切并未带来永久的幸福,而是死亡的开始。某天,一名红色男子「赤之男」突然现身学校,并将所有丸太的同班同学杀害,并置入一个红色核心置入丸太的体内。原本见到事实的丸太以为将被赤之男杀死,醒来却在躺医院得以幸存,但这活着却彻底改变了他的一生命运。被拯救后的丸太,表面虽在辨护律师「玉木常长」帮忙下,最后仍被末名冠上莫须有的罪名予以起诉,最后的判决竟是处以「死刑」,被强迫送至了民营化的监狱「DEADMAN WONDERLAND(亡灵幻境乐园)」。亡灵幻境乐园是以东京复兴为目的,在日本建立了唯一的民营化刑务所,表面上是为了各种囚犯而建立,并让人观光的乐园,但其实是个利用死囚互相厮杀,并藉此吸引大量金钱投资,把拥有特殊能力的死囚做为实验的不详之地。在这充满绝望的「乐园」里,丸太先与亡灵幻境的看守长「真纪奈」见面,了解了此乐园对各种刑犯的残酷,并终身被监禁无法离开这座乐园,在绝望的底下,与青梅竹马的神秘少女「白」再次相遇,而这是否得到真正救赎?丸太对抗死亡命运的战斗就此展开……